O Conselho do CDT é a área competente para prestar orientação, aconselhamento e recomendações à Diretoria do CDT, além de deliberar sobre a execução de atividades de ensino, pesquisa e extensão para a comunidade interna e externa à Universidade.
O Conselho é nomeado pelo(a) Decano(a) de Pesquisa e Inovação, devendo ser constituído por:
I - Diretor(a) do Centro.
II - 1 (um) membro do Parque Tecnológico da UnB;
III - 1 (um) membro para cada uma das Coordenações de área do CDT;
IV - 1 (um) membro Coordenador de Extensão do CDT;
V - 3 (três) membros Coordenadores de Pesquisa e Inovação, sendo 1 (um) de cada de uma das seguintes grandes áreas de conhecimento, a saber:
a) Ciências da Vida (IB, FAV, FS, FEF, FM);
b) Ciências Exatas e da Terra (IE, IF, IG, IQ, FT);
c) Ciências Humanas e Sociais (FAU, FE, IdA, IH, IL, IP, Face, FCI, FAC, FD, ICS, Ipol, Irel).
VI - 1 (um) membro Coordenador de Pesquisa e Inovação, representante de cada um dos Campi FCE, FGA e FUP;
VII - 1 (um) membro representante dos servidores técnicos administrativos.
A Secretaria Administrativa do CDT (SEC-ADM) é a área responsável por apoiar o Conselho do CDT, organizando as reuniões ordinárias, convocando os membros para participação na reuniãoes e elaborando as respectivas Atas.